AU Forskning består af Forskningsdatakontoret (FDK), Forskningsstøtteenheden (FSE) og Technology Transfer Office (TTO).
Forskningsdatakontoret yder støtte til AU's forskere i håndtering af forskningsdata i bred forstand. For bedst at give samlet og ensrettet rådgivning samler kontoret enhedsadministrationens ekspertise på en række områder under ét tag. Således består kontoret af den tidligere databeskyttelsesenhed, Open Science koordinatoren, datamanagement-rådgivningen samt URIS og eksportkontrol-rådgivningen. Kontoret faciliterer desuden kontakten fra forskere til såvel DeiC som den eksterne DPO og sekretariatsbetjener ligeledes Forskningsetisk Komité.
TTO bistår alle fem fakulteter på tværs af AU med udarbejdelse og forhandling af forskningsaftaler, samt aftaler i relation til behandling af personoplysninger i forbindelse med forskningen.
TTO arbejder ydermere med udvikling af universitetets relationer til erhvervslivet i forbindelse med kontraktindgåelse og håndtering af regler om persondata i forbindelse med forskningsprojekter, mv.
Forskningsstøtteenheden bistår alle fem fakulteter med rådgivning ifm. forskningsansøgning og -administration, udvikling af finansieringsstrategier for institutter og forskningsgrupper, ledelsesbetjening af Forskningsudvalget, bibliometri, administration af EU- og koordinatorprojekter, mv.