Til at understøtte indsatsen for mere erhvervssamarbejde har universitetet nedsat et tværgående udvalg for hele universitetet, Erhvervsudvalget, og fire fakultetsudvalg. Herudover findes der også udvalg på flere institutter. Formålet er at styrke koordineringen på tværs af fakulteterne og den interne dialog mellem institutter, fakulteter og det overordnede universitetsniveau.
En koordinationsgruppe bistår erhvervsudvalget med administrativ support. Den består af erhvervschefen, repræsentanter fra fakulteterne, AU Forskning - Technology Transfer Office og AU Uddannelse. Koordinationsgruppen sekretariatsbetjenes af Erhvervsstaben.
Fakulteterne har organiseret deres erhvervsudvalg med udgangspunkt i de lokale behov og muligheder. Alle institutter har udpeget erhvervsambassadører.